Накнада за одводњавање се обрачунава у складу с новим  Законом о накнадама за коришћење јавних добара, који је ступио на снагу у децембру 2018. године. Нови закон мења начин обрачуна накнаде за одводњавање, а као основ се, уместо катастарског прихода, узимају  класа  и култура земљишта. Те податке ЈВП „Воде Војводине“ преузима из РГЗ.

Накнада за одводњавање се може платити квартално, као и порез на имовину, или у целости, према вољи обвезника. Обвезници на рачунима добијају уплатнице и упутство о роковима за плаћање.